南昌工程学院在多个专业领域都有较强的实力，以下是一些被广泛认为较好的专业，排名不分先后：

水利水电工程：

这是学校的国家级特色专业，也是王牌专业之一，在全国排名达到第16位，全省排名第一，就业率高达90%以上，多数毕业生能够进入国有企业工作。

电气工程及其自动化：

该专业是学校的传统优势专业，毕业生在电力、电子、自动化等领域具有较强的竞争力。

计算机科学与技术：

学校在这一领域不断加强科研力度，培养了大量优秀的计算机专业人才。

机械设计制造及其自动化：

该专业从省级特色专业升级为国家级特色专业，反映了其在教学质量和科研水平上的持续提升。

审计学：

该专业在多个排名中表现优异，显示出其在财务和管理领域的深厚积累。

智能电网信息工程：

该专业在近年来发展迅速，成为学校的新兴优势专业之一。

通信工程：

该专业在通信领域具有较高声誉，培养了大量优秀的通信技术人才。

自动化：

该专业在自动化领域有着较好的教学和实践条件，毕业生在自动化系统设计与实施方面具有较强竞争力。

能源与动力工程：

该专业在能源动力领域具有较高声誉，培养了大量优秀的能源与动力专业人才。

机器人工程：

该专业是近年来学校重点发展的新兴专业，具有较高的科研和就业前景。

此外，土木工程、水利工程、测绘工程、园林、给水排水工程等专业也被认为是学校的优势专业。

建议学生在选择专业时，可以根据自己的兴趣和职业规划，结合各个专业的学科特点、就业前景以及学校的教学资源和师资力量，做出更为明智的选择。