根据提供的信息，新疆喀什大学在一段时间内确实存在一些困难，具体包括：

封控情况：

学校已封近3个月，并且有半夜拉人隔离的情况发生。

学生伙食：

有学生反映伙食条件不佳，类似泔水。

隔离条件：

隔离点在闲置小区，没有暖气，且生活条件艰苦，例如没有早餐、午餐，甚至不能上厕所。

校庆影响：

有学生表示，因为学校60周年校庆，许多同学被要求返校，但返校后很快又面临封控。

网课与线下课：

学生到校后只上了一周线下课，其余时间均为网课。

疫情防控措施：

在本地无新增病例、学生全封闭的情况下，校内仍出现了疫情。

物资供应问题：

有学生提到，学校外面甚至买不到退烧药，表明物资供应可能存在问题。

以上信息反映了学生在疫情期间所面临的挑战和困境。