2025年日本大学院三本排名榜单如下：

东京大学

京都大学

东北大学

大阪大学

东京工业大学

名古屋大学

九州大学

北海道大学

庆应义塾大学

建议：

东京大学和京都大学在世界大学排名中表现优异，是留学生们的优选之一。

东北大学在理工科领域有很高的声誉，尤其是材料科学和工程学。

大阪大学在商科和医学方面有着很高的排名，是一个值得考虑的选择。

东京工业大学在工程学和材料科学等领域的表现非常突出。

其他如名古屋大学、九州大学、北海道大学和庆应义塾大学也都是日本顶尖的高等教育机构，根据个人兴趣和需求，可以进一步了解这些学校的专业特色和优势。