沈阳大学要比佳木斯大学好。

首先这两所大学都在东北，沈阳大学在辽宁省省会，沈阳是东北的重工业城市，属于大型城市。而佳木斯大学在佳木斯，从地域上看，佳木斯的城市位置显然要比沈阳差很多。

另外，佳木斯大学合并前都是一些非常普通的二流本科院校或专科学校，班底比较薄弱。而沈阳大学则是合并了东北大学和辽宁大学的分院，实力要相对强一些。

另外从教育部第4轮的评估结果，沈阳大学有三个c类学科，而佳木斯大学却只有一个C类学科。

综上所述，沈阳大学要比佳木斯大学强一点。