京都大学拥有以下学院和学部：

1. 综合人类学部（综合人类研究）

2. 文学部（人文学科）

3. 教育学部（教育科学科）

4. 法学部（基础法学、公法、民刑事法、政治学）

5. 经济学部（经济经营学科）

6. 理学部（理学科）

7. 医学部（医学科、人体健康科学科）

8. 药学部（药科学科、药学科）

9. 工学部（地球工学科、建筑学科、物理工学科、电气电子工学科、信息学科、工业化学科等）

10. 农学部（资源生物科学科、应用生命科学科、地域环境工学科、食料环境经济学科、森林科学科等）

此外，京都大学还有18个研究科，包括文学研究科、教育学研究科、法学研究科、经济学研究科、理学研究科、医学研究科、药学研究科、工学研究科、农学研究科、人类·环境学研究科、能量科学研究科、亚非地区研究科、信息学研究科、生命科学研究科、地球环境学大学院、公共政策大学院、经营管理大学院、综合生存学馆等