上海建筑工程专业的排名如下：

同济大学

上海交通大学

华东师范大学

东华大学

上海海事大学

上海理工大学

建议：

同济大学和上海交通大学在上海建筑工程专业中排名靠前，具有很高的声誉和学术实力，是报考的理想选择。

华东师范大学、东华大学和理工大学也是不错的选择，各有其特色和优势。

上海海事大学和上海工程技术大学在特定专业方向上也有很好的表现，可以根据个人兴趣和职业规划进行选择。