学校的说法是“一校两地四区”即一学校（南航），两地区（南京和溧阳），四校区（明故宫校区，将军路校区，天目湖校区，江北校区）

其中大一大二新生（2019级民航/飞行学院本科生除外）全部在将军路校区就读，大三时一，二，五院（航空学院 能源与动力学院 机电学院）要搬到明故宫校区。

民航/飞行学院2019级大一大二会在新校区即常州溧阳的天目湖校区就读，大三部分专业会回到将军路校区。

江北新区划分是国际学院，目前在建

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