商丘市拥有多所本科学校，具体包括：

商丘师范学院

坐落在河南省商丘市，是一所公办全日制普通高等学校。

学校历史可以追溯到1905年创办的“归德府中学堂”，前身为北宋全国四大书院之一的应天书院。

商丘师范学院入选了教育部数据中国“百校工程”产教融合创新项目、国家“十三五”应用型本科产教融合工程规划项目、国家级大学生创新创业训练计划项目、河南省示范性应用技术类型本科院校。

商丘工学院

位于河南省商丘市，是一所民办普通本科高校。

学校以工学为主体，工学、管理学、经济学、教育学、艺术学、医学等多学科协调发展。

商丘学院

是经国家教育部批准的全日制普通本科高校。

学校筹建于2002年，2005年7月被教育部批准设立成名为河南农业大学华豫学院的独立学院，2011年4月教育部同意河南农业大学华豫学院转设为商丘学院。

截止2019年10月，学校现有两个校区：校本部和开封校区（商丘学院应用科技学院），校本部占地2829.27亩，拥有16个教学单位，开设45个本科专业。

综上所述，商丘市的本科学校包括商丘师范学院、商丘工学院和商丘学院，共计3所，其中公办大学1所，民办大学2所。