重庆大学有国家重点实验室18个，还有一个在审批中。

1、机械传动国家重点实验室

2、输配电装备及系统安全与新技术国家重点实验室

3、煤矿灾害动力学与控制国家重点实验室

4、国防重点实验室

5、新型微纳器件与系统技术国防重点学科实验室

6、国家工程中心

7、国家镁合金材料工程技术研究中心

8、国家工程实验室

9、复杂煤气层瓦斯抽采国家工程实验室

10、国际研发中心

11、微纳系统及新材料技术国际研发中心

12、教育部重点实验室

13、光电技术及系统开放实验室

14、西南资源开发及环境灾害控制工程教育部重点实验室

15、三峡库区生态环境教育部重点实验室

16、生物流变科学与技术教育部重点实验室

17、山地城镇建设与新技术（建设）

18、低品位能源利用技术及系统

19、飞行器测控与通信（已经通过立项评审）