仙居县目前有以下高等教育机构：

华东师范大学附属仙居学校：

这是一所公办学校，由华东师范大学和仙居县人民政府合作创办，提供基础教育和优质教育资源。

台州学院文化旅游与大健康产业学院：

这是台州学院与仙居县合作共建的项目，旨在提高应用型人才培养质量，深化“人才强县”战略。

仙居县还在积极引进和建设高等教育资源，以提升当地的教育水平