南京各大学及其专业排名如下：

南京大学

全国排名：

第6名

优势专业：计算机科学与技术、地质学、数学、化学、天文学、生物学、中国语言文学等

东南大学

全国排名：

第23名

优势专业：建筑学、生物医学工程等

南京理工大学

全国排名：

第35名

优势专业：武器系统与工程、化学工程与工艺、自动化、机械工程、电子信息工程、材料科学与工程等

河海大学

全国排名：

第40名

南京师范大学

全国排名：

第45名

南京航空航天大学

全国排名：

第36名

南京农业大学

全国排名：

第38名

优势专业：农业资源与环境等

南京理工大学

全国排名：

第37名

优势专业：武器系统与工程、化学工程与工艺、自动化、机械工程、电子信息工程、材料科学与工程等

南京信息工程大学

全国排名：

第11名

南京工业大学

全国排名：

第50名

建议：

南京大学和 东南大学在全国的排名较高，且有多门优势专业，是南京市乃至全国都非常重视的高等学府。

南京理工大学在理工类专业方面表现突出，尤其是兵工七子之一，具有很高的专业实力。

南京农业大学和 南京航空航天大学在农业和航空航天领域具有明显优势，也是值得考虑的高等教育机构。