哈尔滨师范大学教育科学学院目前设有以下系所：

1. 教育学系

2. 心理学系

3. 教育技术学系

4. 学前教育系

5. 小学教育系

此外，学院还设有研究机构如哈尔滨师范大学陶行知研究所、哈尔滨师范大学心理测量与咨询研究所，以及省级人文社科重点研究基地如基础教育课程与教学研究中心、学校心理教育研究基地等。

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