自动化专业通常隶属于 自动化科学与电气工程学院（简称自动化学院）。例如，北京航空航天大学电力电子技术学科就隶属于该学院。此外，清华大学、浙江大学等工科实力较强的院校也通常将自动化专业设置在自动化学院或控制科学与工程学院。

有些情况下，自动化专业也会与电气类专业设置在一个学院，例如电气工程与自动化组成电气信息工程学院。还有如中国科学院自动化研究所，它以智能科学与技术为主要定位，并不直接隶属于某个学院，但从事自动化相关的研究。

综上所述，自动化专业主要隶属于自动化科学与电气工程学院，具体归属可能会因不同高校而异。