集美大学拥有多个王牌专业和特色专业，以下是一些被广泛认为最好的专业：

轮机工程- 国家级特色专业，培养能在船舶运输及相关企事业单位从事轮机工程相关设备和系统的运行维护、修造、管理和技术开发等工作的高级工程技术人才。

财政学- 国家级特色专业，专注于财政方面的研究和应用。

航海技术- 国家级特色专业，培养适应现代航海需要的工程技术人才。

水产养殖学- 国家级特色专业，专注于水产养殖领域的教学和研究。

软件工程- 根据某些排名，软件工程是集美大学的王牌专业之一。

计算机科学与技术- 国家级特色专业，培养在计算机及相关领域进行技术管理以及软硬件系统研究、设计、开发和维护的能力。

通信工程- 专业的通信技术教育和研究。

数学与应用数学- 包括师范类和非师范类专业，为数学领域培养人才。

机械设计制造及其自动化- 专业的机械设计和制造教育。

法学- 专业的法律教育和研究。

请注意，专业的“最好”可能因不同的评价标准和时间而有所变化。建议查看集美大学官方网站或相关教育部门发布的最新信息，以获得最准确的排名和专业信息