2025年日本最好的医学院排名如下：

东京大学理科三類（医学部）

东京大学医学部以其严苛的入学标准和高质量的教育闻名，在亚洲乃至世界都享有极高的声誉。

京都大学医学部

京都大学医学部与东京大学医学部类似，都是日本顶尖的医学教育机构，教学质量和研究实力均位于前列。

大阪大学医学部

大阪大学医学部作为日本7所帝国大学之一，在临床医学和基础医学方面表现突出，最新世界排名中位列第55名。

东北大学医学部

东北大学医学部以“研究第一”为目的，拥有高端研究教学设施，并聘请了许多高级医学教员，是各国留学生求医学的首选之一。

慶应義塾大学医学部

慶应義塾大学医学部是私立大学中的佼佼者，但其医学学费较为昂贵，不适合工薪家庭留学生选择。

九州大学医学部

九州大学医学部是日本7所帝国大学之一，西日本医学名校的代表，世界知名度非常高。

东京医科歯科大学医学部

东京医科歯科大学医学部是日本最好的牙科大学，综合实力强，适合学牙科的学生。

奈良医科大学医学院

奈良医科大学医学院以MBT（Medicine-based Town）为特色，期望学生利用专业技能为社会做出贡献。

这些排名综合了不同来源的数据，并考虑了各医学院的教学质量、研究实力、世界知名度以及留学生评价等因素。建议根据个人兴趣、学术目标和财务状况等因素，综合考虑这些医学院的优劣。