以下是新疆药学专业的院校排名情况：

喀什职业技术学院（排名第1）

昌吉职业技术学院（排名第2）

新疆现代职业技术学院（排名第3）

建议：

如果优先考虑职业技能教育，喀什职业技术学院、昌吉职业技术学院和新疆现代职业技术学院是较好的选择。

对于追求学术研究和更高学历的药学专业的学生，新疆医科大学和新疆第二医学院是更为理想的选择，这两所学校在临床药学专业方面有着较高的教学水平和研究实力。