南通理工学院的一些王牌专业和一流本科专业包括：

1. 机械设计制造及其自动化

2. 物流管理

3. 汽车服务工程

4. 新能源科学与工程

5. 土木工程

6. 电子商务

这些专业被认为是南通理工学院最好的专业，并且根据不同的评价体系和排名，它们在不同年份和不同评价中可能有所变化。建议关注南通理工学院的官方公告和最新排名信息，以获得最准确的排名和专业信息