郑晓峰教授的研究领域主要集中在细胞生物学和分子生物学，特别是与肿瘤耐药性、细胞信号传导、DNA损伤修复以及胚胎发育相关的分子机制。他的研究组在多个学术期刊上发表了研究成果，涉及以下方面：

肿瘤耐药性

研究了CD98hc在ENKTL淋巴瘤细胞中通过外泌体介导的药物抵抗机制。

揭示了hCINAP和NEDD4在胚胎发育过程中对胚层分化的调控作用。

阐述了乙酰转移酶ESCO2在DNA损伤修复和结直肠癌耐药性中的作用。

探讨了OTUD6A在乳腺癌进展和DNA损伤修复中的作用。

描述了SUMO化修饰如何影响NHEJ修复效率和肿瘤细胞耐药的分子机制。

细胞信号传导

研究了HSCARG蛋白在细胞氧化还原状态和一氧化氮信号通路中的作用。

分析了HSCARG蛋白的晶体结构及其在TLS（跨损伤DNA合成）途径中的调节功能。

郑晓峰教授的研究工作对于理解细胞如何响应和处理各种生物和病理过程具有重要意义，并为开发新的治疗策略提供了理论基础。