集美大学的主攻专业包括：

轮机工程：

被誉为“海上工程师的摇篮”，培养具有轮机管理知识和技能的高级船员。

财政学：

作为学校的王牌专业之一，财政学专业在学术界和业界都享有较高的声誉。

航海技术：

作为学校的特色专业，航海技术专业培养了很多优秀的航海人才。

水产养殖学：

在福建省内属于特色重点学科，专业含金量高。

除此之外，集美大学还有其他诸如软件工程、计算机科学与技术、机械工程、会计学、视觉传达设计等专业，均具有较高声誉和就业竞争力。