2025年药物化学专业的医学院排名如下：

1. 北京协和医学院（A+）

2. 中国药科大学（A+）

3. 北京大学（A）

4. 沈阳药科大学（A）

5. 浙江大学（A）

6. 复旦大学（A）

7. 上海交通大学（A）

8. 山东大学（A）

9. 中山大学（A）

10. 四川大学（A）

建议：

北京协和医学院和 中国药科大学在药物化学专业排名中位列前二，显示出其在药学领域的极强实力，考研难度也相对较大。

沈阳药科大学、 浙江大学、 复旦大学、 上海交通大学、 山东大学、 中山大学和 四川大学也都是药物化学专业排名靠前的院校，具有较高的教学水平和研究实力。

学生在选择院校时，建议综合考虑自身兴趣、研究方向、院校地理位置等多方面因素，排名信息可以作为参考，但更重要的是找到最适合自己的学校。