南京最好的大学是南京大学。以下是南京大学的一些亮点：

985工程和 211工程重点建设高校。

双一流世界一流大学A类建设高校。

入选多个国家重点发展项目，如 珠峰计划、 强基计划、 111计划、 2011计划。

属于九校联盟（C9）、中国大学校长联谊会、环太平洋大学联盟等多个国际学术联盟成员。

在教育部第四轮学科评估中，有21个学科获得A级别评分。

拥有丰富的本科专业，并在天文学、地质学、图书情报与档案管理等领域具有显著优势。

南京大学以其卓越的学术研究和教学实力，在自然科学、人文学科等领域有显著成就。