南通大学新增的学院包括：

1. 南通大学杏林学院与江苏工程职业技术学院合并转设为江苏工程职业技术大学。

2. 南通大学微电子学院（集成电路学院），这是根据市政府与南通大学的“名城名校”融合发展战略协议成立的第一个新建学院。

3. 南通大学经济管理学院，该学院于2023年成为MPAcc招生院校。

请注意，以上信息基于提供的参考信息，具体的新增院校情况可能会有变动，建议直接咨询南通大学或相关教育部门获取最新信息