秘鲁拥有一些著名的大学，以下是部分知名高等教育机构的列表：

圣马科斯国立大学：

成立于1551年，是拉丁美洲最古老的大学之一，提供本科和研究生课程。

秘鲁天主教大学 （Pontificia Universidad Católica del Perú, PUCP）：成立于1917年，是秘鲁最古老的私立大学，以卓越的教学和研究质量著称。

利马大学（Universidad de Lima）：成立于1962年，位于秘鲁首都利马，是一所注重国际交流与合作的著名私立院校。

卡耶塔诺埃雷迪亚大学（Universidad Peruana Cayetano Heredia, UPCH）：位于秘鲁首都利马，是另一所著名的私立大学。

秘鲁应用科技大学：

位于秘鲁首都利马，是一所私立综合性高等院校，被认为是秘鲁最好的五所大学之一。

国立农业大学：

是秘鲁的重点大学之一，在秘鲁享有较高的知名度。

秘鲁的教育体制为学前教育1至2年，小学6年，中学6年，大学5年。全国著名高等院校大多集中在首都利马。