哈尔滨工程大学的导航工程专业在全国的排名是第三。以下是具体的排名信息：

1. 中央财经大学

2. 武汉大学

哈尔滨工业大学 （威海）

4. 南京航空航天大学

5. 西南交通大学

6. 湖南大学

7. 电子科技大学

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