2024年南京大学软件工程专业的排名如下：

清华大学（985）

南京大学（985）

北京大学（985）

浙江大学（985）

上海交通大学（985）

电子科技大学（985）

哈尔滨工业大学（985）

复旦大学（985）

因此，南京大学在2024年软件工程专业的排名是 第二名。