根据最新的排名信息，全国生态学专业的顶尖大学包括：

1. 北京大学（等级为A）

2. 复旦大学（等级为A）

3. 中山大学（等级为A）

4. 浙江大学（等级为A）

5. 北京师范大学（等级为A）

6. 华东师范大学（等级为A）

7. 厦门大学（等级为A）

8. 南京大学（等级为A）

9. 兰州大学（等级为A）

10. 四川大学（等级为B）

这些排名基于软科2024年的专业排行榜，并且北京大学在生态学领域的实力被认为是最强的，位列榜首。