截至2024年，全国环境微生物专业的排名如下：

1.  武汉大学：在环境微生物方面属于全国一流水平。

2.  山东大学：在环境微生物发酵及理论方面很有水平。

3.  中山大学：在环境微生物生物防治方面很好，有国家生防重点实验室。

4.  复旦大学：在微生物学专业中排名第一。

5.  中国科学技术大学：在微生物学专业中排名第四。

6.  华中农业大学：在微生物学专业中排名第五。

7.  中国农业大学：在微生物学专业中排名第六。

8.  南开大学：在微生物学专业中排名第八。

9.  云南大学：在微生物学专业中排名第九。

10.  浙江大学：在微生物学专业中排名第十。

11.  上海交通大学：在微生物学专业中排名第十一。

这些排名综合了不同来源的信息，并考虑了各学校在环境微生物领域的科研实力、学术声誉和研究成果。建议在选择学校时，可以综合考虑这些排名信息，同时也要考虑个人的研究方向和兴趣。