昌吉学院函授学费标准如下：

专升本

汉语言文学：3000元/年

英语：3600元/年

数学与应用数学：3500元/年

应用化学：3500元/年

自动化：未提供具体学费，但通常与理工科其他专业学费相近

高升本

未提供具体学费标准，但通常与专升本学费相近

建议选择专业时，查阅最新的招生简章或官方通知，以获取最准确的学费信息。