当前无人驾驶航空器系统工程专业大学排名如下：

北京航空航天大学

电子科技大学

南京航空航天大学

沈阳航空航天大学

中国民航大学

郑州航空工业管理学院

天津中德应用技术大学

南昌航空大学

珠海科技学院

滇西科技师范学院

以上排名根据最近更新的信息整理而来，具体排名可能会根据不同的评价标准和时间点有所变化。