常熟理工学院的专业排名如下：

新能源科学与工程- 中国顶尖应用型专业

自动化- 中国顶尖应用型专业

生物工程- 中国三星级学科（3）

机械工程- 中国三星级学科（3）

电子信息工程- 中国三星级学科（3）

数学与应用数学- 中国顶尖应用型专业

食品质量与安全- 中国三星级学科（3）

材料科学与工程- 中国三星级学科（3）

计算机科学与技术- 中国顶尖应用型专业

市场营销- 暂未提供具体排名信息

请注意，排名信息可能会随时间更新，请以常熟理工学院官方最新公布的信息为准。