京都顶尖大学包括以下几所：

京都大学：

简称京大，是一所本部位于日本京都市左京区的日本顶尖研究型大学，在日本仅次于东京大学。京都大学在全世界享有很高的声望，被誉为“科学家的摇篮”。

龙谷大学：

位于日本京都，是一所成立于1639年的一流私立大学，同时也是全日本古老的综合性大学之一。

立命馆大学：

成立于1900年，是日本一所知名的私立大学，位于京都市区北部，前身为私立学校“立命馆”。

京都精华大学：

位于京都府京都市左京区岩石仓木野町137，简称精华大或精大，是一所1968年创办的私立大学。

京都产业大学：

是一所综合性私立大学，位于京都府，大约有2万名学生在其中学习。

京都市立艺术大学：

又称京都艺大、京艺大，是于1880年建立，1950年开设大学教育的日本公立艺术类大学，是西日本最有代表性的美术大学和音乐大学。

同志社大学、 关西大学、 京都圣母学院、 京都教育大学、 京都府立大学、 京都府立医科大学、 京都市立工业维修大学等也是京都地区知名的高等教育机构。

这些大学在不同领域具有各自的优势和特色，可以根据个人兴趣和目标选择适合的学校。