制药工程专业的学科设置涵盖了化学、生物学、药学和工程类等多个领域。本科阶段主要学习的课程包括：

有机化学：

研究碳化合物的性质、结构、反应及合成。

无机化学：

研究无机物的性质、组成、结构、变化规律及其化合物。

生物化学：

研究生物体内化学过程和物质。

化工原理：

研究化学工业中单元操作的基本原理和规律。

药物化学：

研究药物的设计、合成、结构和性质。

药理学：

研究药物的作用机制、药效学、药代动力学等。

药剂学：

研究药物制剂的设计、制备、质量控制等。

药物合成反应：

学习药物合成的基本反应和工艺。

制药工艺学：

研究药品生产的工艺流程和操作方法。

生物技术：

利用生物系统、活体或其部分、活体分子等进行研究。

生物制药：

利用生物技术进行药品的生产和研究。

中药学：

研究中药的采集、加工、应用和理论。

制药设备与车间设计：

学习药品生产所需的设备和车间设计。

药事管理学：

研究药品生产、流通、使用等环节的管理法规。

药品营销：

学习药品的市场推广和销售策略。

此外，部分课程如 天然药物化学、 应用光谱解析、 药用高分子材料、 制药分离工程、 药物分析等，涵盖了从药物发现到生产的各个环节。

综上所述，制药工程专业的学科设置旨在培养学生掌握从药物设计、合成、生产到质量控制等全面知识，使其具备在医药行业从事研发、生产、管理等多方面工作的能力。建议学生在选择制药工程专业时，重点关注其交叉学科的性质，以便更好地理解和应用所学知识。