复旦大学社会科学高等研究院主办了一系列高质量的学术期刊和系列丛书，其中包括:

《中国社会科学辑刊》(原名《中国社会科学季刊》)，作为院刊，定期发表深度研究论文。

《当代中国研究》为半年刊，聚焦于当代中国议题的深度探讨。

《复旦政治哲学评论》同样为半年刊，专注于政治哲学领域的前沿观点。

《西方法律哲学家研究年刊》则是专门研究西方法律哲学的重要平台。

此外，研究院还出版了一系列精选的讲座记录，如《中国深度研究高级讲坛讲演录》和《世界社会科学高级讲坛讲演录》。

对于英文出版物，他们推出了《当代中国发展论丛》英文丛书，以及《重新发现中国文丛》，展示中国文化的全球视角。同时，与耶鲁全球化研究中心合作，共同运营“耶鲁全球在线复旦版”(Yale Global Online, Fudan Edition)，提供全球化视野下的学术交流。

研究院还协助编辑了综合性人文社科英文季刊Fudan Journal of the Humanities and Social Sciences，进一步推动跨文化交流与学术研究。