西昌学院更好。

1、在四川省的大学排行榜中，西昌学院排名第24位，全国排名第580位；四川民族学院排名第27位，全国排名第610位。

2、西昌学院肇始于1939年北洋工学院内迁西昌创建的国立西康技艺专科学校；四川民族学院肇始于1985年设立的“康定民族师范专科学校”。西昌学院历史更加悠久。

3、西昌学院立项建设1个国家级特色专业、1个国家级综合改革试点专业、1个国家级大学生校外实践教育基地、2个国家级卓越农林人才教育培养计划项目；四川民族学院建有四川省社会科学重点研究基地，成立了14个特色研究中心和14个特色研究所。两所大学虽然方向不同，但相对而言西昌学院更好一些。