昆明学院的前身是1980年5月建立的昆明师范高等专科学校和1984年3月建立的昆明大学。

2004年5月经教育部批准，在昆明师范高等专科学校和昆明大学合并的基础上，建立昆明学院。

2009年7月，昆明市农业学校、昆明市卫生学校并入昆明学院。