北部湾大学应用型本科专业采用的是“2+1+1”教学安排，即前两年在北部湾大学学习，第三年在广西工业职业技术学院学习，第四年在企业进行专业实践。北部湾大学应用型本科招生的专业有土木工程、机械设计制造及其自动化专业、化学工程与工艺。