最大的区别是资金来源不同，公办大学经费来自政府，民办大学来自个人或企业。公办院校与民办院校都是经相关部门批准的具有独立颁发资格的学校，根据《民办教育促进法》的规定，民办院校的学生与公办院校学生的待遇是完全一样的。