环境工程专业的课程分为公共课和专业课。公共课主要是政治、英语，而专业课分为四类，包括土建概论、环境微生物学、环境分析与监测、化工原理等专业基础课程；排水工程、固体废弃物处理，工业废水处理等专业必修课程；环境经济与管理、环境工程施工等专业选修课程；水处理课程设计、毕业设计等专业实践课程。