二者不是一个概念，公办本科院校是受国家认可批准的，毕业证任何地方都是认可的，设施等都是完整齐全的。

独立本科学院就是民办本科，民办学校的一种，民办院校学费贵，毕业认可度可能没有公办院校高，建议上公办本科院校。