齐鲁工业大学在菏区开设的专业主要有建筑工程与技术，对外贸易，经济誉理，数理统计，马列主义教育，网络通信与系统安全等。

齐鲁工业大学菏泽校区开设的专业有有化学工程与工艺、制药工程、食品科学与工程、高分子材料与工程、市场营销5个专业。