重庆中医药学院（Chongqing College of Traditional Chinese Medicine）前身为1951年西南军政委员会卫生部创办的重庆中医进修学校，曾先后更名为四川省重庆中医学校、重庆市中医学校。

2001年重庆市中医学校整体并入重庆医科大学，组建了重庆医科大学中医药学院。

2022年经教育部批准，重庆医科大学中医药学院、重庆市中医院、重庆市中药研究院、重庆市药物种植研究所整合组建重庆中医药学院。