代垫运费通常应计入“应收账款”科目。具体的会计分录如下：

借：应收账款（含税价款 + 代垫运费）

贷：主营业务收入

应交税费—应交增值税（销项税额）

银行存款（代垫运费）

当收回代垫的运费时，会计分录为：

借：银行存款

贷：应收账款

请根据您的具体情况选择合适的会计科目进行核算