灌云县辖下共有12个镇和12个乡，具体如下：

镇：

伊山镇

杨集镇

同兴镇

四队镇

圩丰镇

龙苴镇

燕尾港镇

下车镇

侍庄乡

图河镇

东王集镇

小伊乡

南岗乡

乡：

伊芦乡

鲁河乡

白蚬乡

穆圩乡

陡沟乡

向阳乡

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