基金从业资格证书的申请流程如下：

个人申请

个人首先需要在所在机构办理入会申请，并向基金业协会申请从业人员管理系统账户。

机构指定资格管理员，由资格管理员通过从业人员管理系统进行从业人员的注册、变更、离职备案、年检等工作。

个人在所在机构任职并取得从业资格后，即可通过机构向基金业协会申请基金从业资格证书。

机构申请

机构需要向基金业协会申请从业人员管理系统账户。

机构资格管理员通过管理平台为从业人员申请注册基金从业资格。

个人提交注册申请，机构审核后进行内部公示。

经过内部公示后，机构将申请提交给基金业协会。

基金业协会受理申请并进行外部公示。

完成外部公示后，个人即可取得基金从业资格证书。

注意事项：

基金从业资格考试两科成绩均合格后，考生可以获得成绩合格证。

成绩合格证不等同于基金从业资格证书，需要通过所在单位申请。

通常情况下个人不能申请从业资格证，需要个人先向单位相关人员提出申请，注册个人资格账户。

证书申请的时间限制为4年，超过四年未通过机构申请注册基金从业资格的，在重新参加并通过从业资格考试或补齐最近两年的规定后续培训学时后，可以重新通过所在机构申请证书。

以上信息基于最新发布的参考信息，请以基金业协会官网的最新公告为准。