吉首大学的专业中，软件工程是最强的专业之一，它被评为国家级特色专业，并且在省内的排名中名列前茅。根据最近的信息，软件工程专业的投档线为539分，显示了其在学生和家长中的受欢迎程度以及专业实力。

此外，吉首大学还有其他一些王牌专业，包括：

临床医学

电子信息工程

通信工程

统计学

机械设计制造及其自动化

金融工程

物理学（师范类）

生物科学（师范类）

土木工程

这些专业在各自的领域内也享有较高的声誉，为学生提供了良好的教育和就业前景。