云南省内最好的大学包括：

云南大学

学科实力强，拥有民族学、生态学等世界一流学科建设学科和国家重点学科。

在全国和云南省的学科排名中均表现优异。

昆明理工大学

以工科为主，拥有冶金工程、环境科学与工程等B+类专业。

在全国和云南省的学科排名中均表现突出。

云南师范大学

以师范教育为主，是云南省培养师范类人才的重要基地。

云南民族大学

以少数民族为特色，致力于培养少数民族地区的高级专门人才。

云南财经大学

在经济学和管理学领域有较强实力。

昆明医科大学

是云南省规模最大的医学院校，口腔医学、药学等专业为国家级特色专业。

以上排名基于最近的数据和排名信息，但请注意，大学排名可能会随着时间和各种评价标准的变化而有所调整。