南方科技大学是一所理工科实力非常强大的高校，拥有多个优势专业。以下是一些被广泛认为最好的专业：

物理学：

物理学专业是南方科技大学的王牌专业之一，入选国家级一流本科专业建设点，并在多个排名中表现优异。

化学：

化学专业同样入选国家级一流本科专业建设点，并在多个排名中表现突出，特别是在高端人才和学术论文方面。

材料科学与工程：

该专业在材料科学、化学、物理学等多个学科进入ESI全球排名前1%的背景下，表现尤为优秀，并在2024年软科中国最好学科排名中入选一流学科。

数学与应用数学：

数学与应用数学专业也是南方科技大学的王牌专业之一，入选国家级一流本科专业建设点，并在广东省高等教育“冲一流、补短板、强特色”提升计划中成为重点建设学科。

生物医学工程：

生物医学工程专业在生物医学工程领域表现突出，受到广泛好评。

计算机科学与技术：

计算机科学与技术专业也是南方科技大学的一个优势专业，入选国家级一流本科专业建设点。

光电信息科学与工程：

该专业在电子与电气工程系设立，是南科大首批设立的院系之一，表现优异。

综上所述，南方科技大学在物理学、化学、材料科学与工程、数学与应用数学等专业方面具有显著优势，这些专业不仅在学术研究上表现突出，也在实际应用中具有较高的价值。建议学生在选择专业时，可以根据自己的兴趣和职业规划，综合考虑这些专业的实力和就业前景。