贷：银行存款/应付账款/其他应付款

当运输企业支付运费时，其会计分录通常如下：

支付给运输企业的运费

借：销售费用/原材料/固定资产/在建工程等

贷：银行存款/应付账款/其他应付款

支付给其他企业的运费 （例如销售商品时支付给客户的运费）：

借：销售费用/其他应收款

贷：银行存款

支付给供应商的运费（例如购买材料时支付给供应商的运费）：

借：原材料/库存商品

贷：银行存款

支付给员工的运费补贴（例如员工出差时支付的运费补贴）：

借：应付职工薪酬——职工福利费

贷：银行存款

支付给客户的运费补贴（例如客户给予的运费补贴）：

借：银行存款

贷：其他业务收入——运费补贴

支付给运输企业的预付款

借：预付款项——运费

贷：银行存款

支付给运输企业的运费结算

借：应付账款——运输费

贷：银行存款

支付给运输企业的运费结算单

借：主营业务收入——运输收入

应交税费——应交增值税（销项税额）

贷：银行存款

支付给运输企业的原材料运费

借：原材料（含运费）

贷：应付账款或银行存款

支付给运输企业的其他应付款（运费）

借：其他应付款

贷：银行存款

请注意，具体的会计分录可能因企业的具体情况和会计政策而有所不同。务必遵循当地的会计准则和法规。