南京专转本可以选择的学校包括：

1. 公办院校：

南京信息工程大学

南京工业大学

南京邮电大学

南京工程学院

南京林业大学

南京审计大学

南京晓庄学院

金陵科技学院

江苏第二师范学院

南京工业职业技术大学

南京特殊教育师范学院

2. 其他院校：

南京航空航天大学金城学院

南京动力高等专科学校

南京工业职业技术学院

南京特殊教育职业技术学院

江苏联合职业技术学院

江苏海事职业技术学院

南京交通职业技术学院

南京化工职业技术学院

江苏农林职业技术学院

南京铁道职业技术学院

南京信息职业技术学院

南京机电职业技术学院

正德职业技术学院

应天职业技术学院

3. 综合性大学：

南京大学

南京师范大学

南京中医药大学

河海大学

南京理工大学

南京体育学院

东南大学

南京医科大学

中国药科大学

南京财经大学

南京艺术学院

南京审计大学（2024年招生简章提及）

以上信息根据最近更新的数据整理而来，具体选择学校时，建议查看各个学校的最新招生简章或直接咨询学校招生办公室以获取最准确的信息