截至2024年，新疆共有以下海关：

阿拉山口海关

喀什海关（副厅级海关）

霍尔果斯海关

吐尔尕特海关

红其拉甫海关

伊宁海关

塔城海关

阿勒泰海关

伊尔克什坦海关

都拉塔海关

机场海关

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